Департамент організаційного забезпечення діяльності
Департамент аналізу інформації та управління ризиками
Головний підрозділ детективів (на правах Департаменту)
Оперативно-технічне управління
Департамент детективів із стратегічного захисту економіки
Департамент цифрового розвитку, цифрових трансформацій і цифровізації БЕБ
Управління матеріально-технічного забезпечення
Департамент забезпечення документообігу та контролю
Режимно-секретне управління
Управління міжнародного співробітництва
Управління оперативної підтримки
Департамент детективів внутрішньої безпеки та захисту працівників
Сектор спеціального зв'язку
Сектор запобігання та виявлення корупції
Сектор з питань мобілізаційної роботи
Сектор оперативних розробок